２つの注意点としては、ロボット図鑑、キャラクター図鑑、ムービーの引継ぎ。
Ｆ完結編では、ロボット図鑑、キャラ図鑑ともにリセットされる。
前編での達成度は関係なく１からやり直し。
デモに関しては、サターン版のみ前編から引継ぎ可能。
マスターを仲間にすると、最終面で「究極石破天驚拳」のムービーを見れる。
当然、マスター生存時は「東方不敗暁に死す」と「ラブラブ石破天驚拳」は見れないので、
マスター生存、死亡ルートを両方プレイする必要がある。
主人公がリアル系ではもちろんグルンガストのムービーは見れない（これもまあ･･･）
（引き継ぎの情報が違っていたのでこの項目は書き直しました）
２つ目に、敵キャラの説得フラグ。
トッドの説得フラグは２作分にまたがっており、トッドはＦで説得しなければ絶対に仲間にならない。
レッシィを敵にしたままでどうなるかは確認していないが、ただ出てこなくなるだけだと思われる。
Ｆ（前編）だけに登場するロボットの一部まとめ。
ゲッター１～３、クーロンガンダム、
第６使徒ガギエル、オレアナ、ビッグガルーダ、マグマ獣デモン、ガロイカ
※第３使徒サキエル、第４使徒シャムシエルは完結編にも登場するが、隠しシナリオＭＡＰのみ。
ゲシュペンストはスーパー、リアルで図鑑が個別に存在する事も注意。
エヴァ初号機（暴走）とダミープラグ（パイロット）は初号機を１回は暴走させないと登録できない。
イデ（パイロット）も同様に、登録漏れしやすい。
・Ｆ完結編で何故かロボット図鑑に登録されないユニット（マップ上でセーブしても無理）
ハイパーレプラカーン、ハイパーライネック、ハイパーガラバ
ヒュッケバイン、グルンガスト（ウイングガスト、ガストランダー）、ダンバイン（トッド用）
これらの入手する・しないに関係なく図鑑は１００％に出来る。
