・難易度取得でイージー、ノーマル、ハードの3種類に分かれ、それによって取れるユニットが変わる。
・ユニットによって改造の最大数値に差がある。
思わぬ弱小ユニットがフル改造すると大化けする(ガンブラスター等)
・バザーでブルーストーンを消費してMSとザブングルのWMが購入・売却できる
・ネオグランゾンは9話で出るが、素のグランゾンはハードルートに行かないと出ない。
・SRXチームはR-2が不在のためSRXに合体する事はない。
・αシリーズの主人公は登場しない。代わりに鉄也が主人公クラスの活躍をする。
・マジンカイザーを取得してもマジンガーZはそのまま自軍に残る。